Убедительная просьба к модераторам сайта, удалить все мои стати с ресурса и закрыть аккаунт, поскольку у меня нет возможности сделать это самостоятельно. А на данном сайте УМЫШЛЕННО занижают рейтинг не разобравшись в сути вопроса. Собственно одну статью модераторы удалили, когда она только появилась. Полагаю, стоит развивать собственный ресурс в виде "визитки": https://vrnnet.ru. Благодарю за внимание.
Добрый вечер, уважаемые жители Хабра. Из моих постов написанных ранее, понятно что я программист, но немного увлекаюсь генетикой, и хотел бы задать вопрос тем, кто в этом разбирается лучше. Как программисту встраиваемых систем, мне часто приходится использовать контрольные суммы данных, для определения целостности при передаче.
Несколько месяцев назад я задумался, над существованием в клетках подобных механизмов. Как известно существует два вида деления клеток. Митоз и мейоз. В результате мейоза формируются половые клетки, в результате митоза обычные. Речь идет о митозе. В процессе деления клетки происходит разделение молекулы ДНК, а затем достраивание комплементарных частей. В данном процессе участвует фермент полипераза. Однако, в процессе деления, или в процессе жизни клетки происходит нарушение последовательности ДНК. Я задумался, а нельзя ли применить механизм аналогичный тому, который используется при передаче информации между электронными устройствами. Т.е. нельзя ли в геном добавить проверочную информацию. Исходя из того что я изучал ранее, мне известно что внутри генов имеются участки, называемые интронами. Это участки генов, не участвующие в формировании белков. А что если использовать данные участки для хранения "контрольных сумм", и модифицировать фермент полимереза, для того чтобы он, например обрывал нить ДНК, в случае если контрольная информация не верна.
Полагаю, это может избавить человечество от всех ретровирусов и рака. Возможно ли это?
P.S. Если что, я прекрасно понимаю что такое интроны, кодоны, метилирование ДНК, что такое полимераза, РНК-поимераза, и.т.д., хотя быть может иногда называю другими словами, которые отражают суть, поскольку являюсь дилетантом, по сравнению с людьми, которые занимаются реальными НАНО-биологичемкими исследованиями. Но мне понятно для чего начинают опскать рейтинг статьи такие же дилетанты, или даже люди совсем не разбирабщиееся в сути вопроса. Не понимаешь,- пропусти. В данной статье всего в нескольких предложениях был предложен вариант, как реально избавиться от рака, что, через несколько часов вызвало появление другой подобной статьи, собственно просто более интересно написанной в плане "научпоп"-а, не более того. А говоря про триплеты, в комментариях я имел ввиду кодоны. Просто кто то делает copy-paste из источников, а кто то действительно хорошо разбирается в том как все это работает, пусть не на уровне нано-биологов, но и не на уровне "научпопа".
Комментарии (23)
Dsp911
05.10.2021 23:36Мутации - по идее путь эволюции. С точки зрения генов, им почти всё равно, что будет, после размножения и рождения. Т.е. раздвоение, а дальше даже если родители тру ля ля, социум не даст умереть члену стаи. Детские дома. Школы интернаты и прочие прелести. Поэтому имеем что имеем. Отбор уже не так работает. Столетие назад не было антибиотиков. Половина детей, до 5 лет не доживала. Смертность при родах. Зато на выходе мы получали индивида, способного спать на морозе. Есть всё что не приколочено. Пахать в поле по 15 часов в сутки и размножаться как кролики. Там эволюция работала. Сейчас тоже работает, но по другому. Не понимаю как. Мы очень хорошо живём.
EvgenySbl Автор
05.10.2021 23:50-3Да, я читал книгу из научпопа "эгоистичный ген", и биографию вида в 24 главах тоже читал. И биологию с экологией со школьного курса помню. Я специально написал статью чтобы ее не минусовали а ответили на конкретный вопрос. Если нет ответа, закрыли и забыли. Если есть ответ то ответили по делу.
Есть два процесса деления клеток. Мейоз и митоз. Один про размножение и про кроликов, а другой, про процессы жизнедеятельности организма с момента рождения. Это не совсем связанные вещи.
Хотелось бы пояснений со стороны членов сообщества хабра, за что статью минуовали... А это комментарий для предыдущего автора сообщения:
Thero
06.10.2021 01:43+1не получали мы такого индивида. отбор так не работал. отбор забавная штука он целиком и полностью строися на случайном стечении обстоятельств из которых только на больших числах выделаются закономерности.
EvgenySbl Автор
06.10.2021 12:36Если я правильно понимаю о чем идет речь, возможно я ошибаюсь, это скорее не вопрос больших чисел, а вопрос формального подхода, и необходиомсть себя "формально" подстаховать. Но это если я правильно понял...
Goupil
06.10.2021 07:44+1Это не совсем верно. Конкретно у людей вовлечение родителей в жизнь детей и внуков помогает их генам передаваться дальше. В естественной среде обитания ребенок без опеки родителей и группы быстро погибал. Человек вообще вне группы долго не жил, из-за чего был отбор на социальность. То что вы описали в истории человечества возникло относительно недавно - в эпоху неолита с появлением сельского хозяйства.
Denai
06.10.2021 00:24А у Turritopsis dohrnii как устроены эти вещи? И у существ, которые рак победили, вроде китов.
EriochromeTheBlack
06.10.2021 01:29+2Денис, если медуза биологически бессмертная, это не значит, что она не подвержена онкологическим заболеваниям. Её опухоль может выглядеть примерно так: ru.wikipedia.org/wiki/Миксоспоридии
И, насколько я знаю, пока ни одного полностью защищённого от рака позвоночного не нашли — даже у голых землекопов уже рак нашли nplus1.ru/news/2016/02/10/naked-mole-cancerDenai
06.10.2021 03:15Между идеальным и достаточно эффективным лекарством огромная пропасть. Если у голых землекопов "наконец" нашли рак, значит его долгое время не находили. И тут либо методы поиска были не очень, либо землекопы круты. А это уже повод воспользоваться их особенностями и комбинировать их с другими особенностями, которые сами по себе в природе не пересекались. Либо доказать что это невозможно, так тоже может быть.
EvgenySbl Автор
06.10.2021 05:13Спасибо! Я ответил несколькими постами ниже. Тема действительно интересна и заслуживает внимания. Но это не наш с Вами, любительский, уровень. Тут патент получат реальные профессионалы. Если я смогу как то поучавтсовать в подобном проекте, то обязательно приму участие, тем более что направление мне интереcно и сам через все это прошел в качестве пациента (не ретровирусы). На самом деле я просто хотел привлечь внимание к другой серьезной проблеме, которая меня коснулась, и может коснуться каждого из Вас. Это глобальная система безмикрофонной прослушки. Я описал о ней и тут и на сайте. И даже описал для чего и как это применяется (копромат на каждого человека, с последующей постановкой в зависимость, в случае если он станет большим человеком). Ко мне обращались и предлагали поучавствовать в подобных проектах, но, по факту, это как минимум статься 137 УК РФ, а потом еще более серьезные статьи УК.
Thero
06.10.2021 16:30а ещё могло оказаться так что землекопы стали чуть более живучи и начали доживать до момента когда у них может развиться рак..
EvgenySbl Автор
06.10.2021 21:15Коллеги, спасибо огромное за столь полезные комментарии, и за то что начали минусовать. Обычно, когда кто-то начинает говорить правду, которая опасна для других, или составляет конкуренцию, его начинают опускать, что собственно и требовалось доказать.
Я хотел лишь сказать что я обычный инженер, который не имеет абсолютно никакого отношения военной или ФСБ-шной специфике. Может быть, за исключением того, что у меня была военная кафедра и я являюсь офицером запаса в определенной тематике, связанной с радиоэлектроникой. Более того, я "догадываюсь" в чем заключается "уборка", но никак с этим не связан и никогда связан не был. Я лишь хороший программист и неплохой разработчик электроники, который всю жизнь занимался только этим, и знает все, начиная от физических процессов в полу/проводниках и заканчивая современной элементной базой, программированием под различные архитектуры, сетевые технологии, хакинг ( белый, реверс-инжиниринг ). Именно мои знания позволили мне ездить в загран-командировки по работе, даже с директорами предприятий. Меня касалась только техническая часть, но поверьте, я и про экономику этих сделок знаю достаточно, хотя, всегда считал что это не мое дело. По этому, собственно, я и знаком со специалистами и директорами ряда не только российских, но и зарубежных компаний. Более того, на последнем курсе университета даже работал на должности заместителя главного бухгалтера, т.к. имею образование и в этой сфере. В своей жизни я открыл несколько интересных и наверное, опасных вещей (никаким образом не связанных с генетикой). Я говорю в том числе про глобальную систему безмикрофонной слежки, а именно про ее физические принципы. А эти вещи стали использоваться другими. Просто, я не хотел чтобы жизнь людей, реально, превратили в ад, т.к. сам прошел через все это. Поверьте, я знаю о чем говорю. Помимо онкологии много чего еще было...
А еще, знаете, есть такой интересный фильм с названим "дурак". Вот я себя ощущаю сейчас в главной роли. Посмотрите,- интересная картина. Похоже только, что вы все поймете, когда дом рухнет. Пусть так и будет, посмотрим кто дурак(и).
EriochromeTheBlack
06.10.2021 01:14+3Евгений, мы как раз написали статью, где изложили свои взгляды на похожую тему. Если интересно, можете ознакомиться. habr.com/ru/post/564978
EvgenySbl Автор
06.10.2021 01:36Да, спасибо. Я ранее уже отпавлял свой материал в Washington Post и Guardian. А еще он был опыбликован тут: https://vrnnet.ru/index.php/ideas, а более конкретно,- тут: https://vrnnet.ru/index.php/ideas/10-genetics-is-it-possible-to-use-introns-to-make-something-like-crc-inside-dna, а сама идея имеет зеркало тут: https://itnan.ru/post.php?c=1&p=566922 :)
EvgenySbl Автор
06.10.2021 01:43То что Вы описали,- материал, подготовленый за несколько дней. У Вас было время успеть его подготовить. Но я хотел бы увидеть реальное описание согласно научным данным. Вы знаете что такое триплеты и каким образом соотноятся триплеты с кодируемым белком и.т.д. Или написали ее на уровне, я компьютерщик и просто привел аналогию выкачав все что есть в интернете?
EvgenySbl Автор
06.10.2021 01:45А Вы хорошо знаете такие технологии как CRISPR-CAS. А знаете что такое CAS9, CAS11, CAS12?
Thero
06.10.2021 01:49тоесть предполагается обеспечить механизм фиксирующий геном в неизменном состоянии? не видится возможности применить это к человеку не потеряв способность его размножения.
но для производства каких-нибудь рнк\векторных вакцин такой механизм проверки целостности для гарантии что все партии вакцины идентичны уже может быть интересен, но совершенно неясно как его осуществить.
EvgenySbl Автор
06.10.2021 05:00Спасибо! На самом деле я лишь неплохой радиоинженер и программист это моя сфера, медицина и генетика это больше любительское с практическим подходом. Этих областей пришлось коснуться, когда с супругой планировали ребенка, но дело оказалось немного в другом, а потом когда, была онкология (вопросы таргетной терапии). Потом понравилась девушка, у которой был болен отец, а на тот момент технологии уже поменялись, и я стал читать материал. Это отступление.
Но, в целом, на каком то уровне есть понимание того, как это работает. Задумка была в том, чтобы каким то образом добавить контрольную информацию именно в процесс копирования ДНК. Если я правильно понял то, что читал ранее, и то, что мне рассказывал мой хороший знакомый, работающий в области медицины, существует несколько типов ферментов, работающих с ДНК. Есть процесс транскрипции из ДНК в РНК которая затем кодирует белки. Есть процесс восстановления ДНК, который протекает разлиными способами, есть процесс копирования ДНК, когда она разворачивается и раскручивается, а затем распадается на две комлементарные нити, которые затем дополняютя комплементарными основаниями. Понятно что любой здравомыслящий человек, не имеющий серьезных генетических деффектов, которые не проявляются как доминантные, не будет себе забивать голову, если только у его второй половинки нет другой какой то аналогичной серьезной сломаной аллели. Если серьезно, то, конечно, я понимаю что за полезную модель в генетике денег не получишь, да я к этому и не стремился, а вот стимулировать процесс привлекая к этому внимание,- можно. У меня была мысль сменить род деятельности, и уйти в генетические исследования, работая в области электроники и программирования. Насколько понимаю это достаточно серьезая сфера, которую немного изучал. Знаю и как электрофарез применяют, и как на куски ДНК нарезают, и про фермент полимераза тоже читал, как его отдельно применяют в ПЦР тестах, насколько я помню температурно циклируя препарат.
Конечно хотелось бы как-то встроить "контрольную сумму", так, чтобы она реально могла использоваться. Если серьезно, то конечно понимаю что контроля целостности всего локуса добиться не получится. Понимаю что есть мусорные участки, участки переключатели, понимаю что есть еще процесс метилирования и все взаимосвязано. Насколько я понимаю, никто не знает в какую часть хромосомы втроится ретровирус. Но, видимо сохранить участки ДНК можно. Я понимаю что она уже частично защищена. Отчасти тем что существует избыточность и несколько комбинации "слов" приводят к кодированию одного и того же белка. А что в этом случае с другими частями ДНК, которые являются просто "переключателями"?
Вопрос, касающийся препаратов, интересен. Насколько я знаю, при создании препаратов применяют в основном бактерии. А у бактерий, если не ошибаюсь, кольцевая РНК. Я не знаю как в этом случае протекают процессы. Тут Вам видимо будет виднее.
Так что пошутили и хватит, полагаю что над данной идеей думал не один человек, и кто то уже давно взял на вооружение. То что я реально летел из Турции и говорил на эту тему с медиками,- тоже правда (я где то тут упоминул). Что же касается электроники то тут я вообще не шутил. И про глобальную прослушку без применения микрофонов как таковых, и про применение обратного эффекта светодиодов для использования экрана в качестве камер (ни кто не задумывлася что сейчас для подключения монитора вместо однонаправленного LVDS применяют eDP который может работать в обе стороны), и про применение лучей ультразвука для генерации обычного звука в нелинейной среде (например в голове). Это все реализуемо на практике. Пример применения в гражданской сфере,- монитор без камеры, который сам является кмерой - первый шаг на пути к телекрану..... Лучше бы этого не было, но, оно есть....
Akon32
06.10.2021 07:19Я задумался, а нельзя ли применить механизм аналогичный тому, который используется при передаче информации между электронными устройствами. Т.е. нельзя ли в геном добавить проверочную информацию.
Речь про переписывание всей ДНК? Теоретически возможно, практически - нет (на данном уровне технологий).
Есть ещё один уровень проверки целостности ДНК - при большом числе мутаций организм нежизноспособен. Можно сказать, проверка практикой.
Кроме того, если реализовать абсолютно строгий контроль целостности ДНК, это (наверно) остановит эволюцию, уменьшит генетическое разнообразие и т.п., что не очень хорошо в стратегическом плане для выживания вида. И возможно, это ещё и уменьшит фертильность - при малейших ошибках ребёнок не будет рождён. Кстати, по каким-то причинам контроль целостности ДНК в природе не абсолютный. Не значит ли это, что организмы без такого контроля имеют какие-то преимущества?
P.S. при чём тут тег "программирование"?.. Не лучше ли вопрос по биологии задать не программистам, а людям, которые в этом гораздо лучше разбираются?
Thero
06.10.2021 16:36количество мутаций само по себе не влияет на жизнеспособность, но если мутации случайны то с ростом их числа вероятность что все они окажутся жизнеспособными уменьшается. потому что нежизнеспособных сочетаний больше чем жизнеспособных.
censor2005
06.10.2021 08:33+1У вас не статья, а вопрос, причём похоже что вы заранее не изучили сам вопрос. Такому больше место на qna.habr.com. Понятно, что вас так заминусовали
bfDeveloper
Звучит замечательно, но это изобретение велосипеда. Механизмов контроля в ДНК навалом, без них мы бы умерли от рака ещё до рождения. Сама днк - raid-1, всё продублировано. В структуре там тоже очень много всего, пусть и не идеального. Плюс апоптоз, плюс иммунитет.
EvgenySbl Автор
Хорошо. Спасибо. Если Вы действительно знаете каким образом происходит контроль целостности ДНК во времмя копирования ферментом, т.е. когда она разделяется на отдельные нити, а затем происходит достравивание комплементарных пар, с удовольствием почитаю. Возможно у Вас имеются ссылки на соотвтествующие статьи?
Я знаю только тот контроль, который восстанавливает поврежденные нуклеотиды или только восстанавливает комплементарный нуклеотид. Т.е. тот RAID-1, о котором Вы говорили. Однако RAID-1 не работал бы если бы не было другого контроля целостности файлов на уровне файловой системы (то о чем я собственно написал). Его частично выполняют другие системы организма/клетки, в.т.ч. иммунитет. А касательно иммунитета, согласен, но посему то он не всегда работает, например с лимфомой, (я болел лимфомой ходжкина несколько лет назад и не по наслышке знаю что такое ПХТ и лучевая терапия).
P.S. Странно, когда ты в статье задаешь вопрос, а его минусуют. Обычно в этом случае дело не в статье, а в конкуренции....
Moskus
При чём тут конкуренция, если ваша "статья" больше похожа на пост в Твиттере? Это надёжный способ уйти в минус, неоднократно проверено.