Приветствуем вас на страницах блога iCover! Можно ли провести тест и проанализировать ДНК в домашних условиях? – Ответ на этот вопрос до недавнего момента выглядел вполне определенно. Попытку изменить ситуацию и подарить такую возможность как любителям, постигающим азы генетики, так и профессионалам, по разным причинам не имеющим доступа к дорогостоящему лабораторному оборудованию предлагает лондонский стартап Bento Lab. Паре из Лондона действительно удалось создать компактный прибор размером со среднестатистический ноутбук. Динамика сбора средств – один из показателей достойного стартового потенциала проекта, выглядит вполне обнадеживающе: до окончания кампании на Kikstarter еще две с половиной недели, а запрашиваемая проектом сумма уже превышена в 2.5 раза.

image

Активный опрос потенциальной целевой аудитории, проведенный авторами уникальной разработки подтвердил: этот прибор сегодня востребован. Причем иметь в своем распоряжении мобильную ДНК-лабораторию весом в 5 кг заинтересованы, как в научном сообществе, поскольку оперативный тест можно получить с помощью Bento Lab можно будет и там, где доступ к дорогостоящему стационарному оборудованию отсутствует. Найти применение Bento Lab смогут повара молекулярной кухни, студенты, только приступающие к изучению основ генетики, фуражиры-эксперты по кормам животных, специалисты-микологи, исследующие грибы, фермеры, пивные производители, спортсмены, тестирующие состав крови на наличие и концентрацию гена выносливости ACTN3, люди, интересующиеся потребляемой пищей на молекулярном уровне и многие другие.

image

Bento Lab позволит, используя биологический образец, извлечь его ДНК и провести простой генетический анализ. Процесс разделен на три этапа. Выделить ДНК из биологического образца – волосяного фолликула, слюны, фрагмента мяса, грибного мицелия и т. п. позволяет центрифуга. Выбрать нужный фрагмент ДНК и получить из него миллионы копий можно, используя термоциклер. Визуальный просмотр и интерпретация результата оказывается возможной благодаря гелевому электрофорезу и подсвеченной платине прибора.

image

Bento Lab будет доступна в двух вариантах комплектации. Состав базового комплекта подразумевает наличие у пользователя базы знаний по молекулярной биологии. В комплекте с прибором будут поставляться набор аксессуаров и реагентов. Таким образом в стоимости 549 фунтов стерлингов (порядка 53 000 рублей) закладывается стоимость самой лаборатории, установка для гелиевого электрофореза, трансиллюминатор, кабель питания, руководство по эксплуатации.

Дополнительный набор, включающий в свой состав буклет для начинающих генетиков, ПЦР-реагенты, реагенты для извлечения и анализа ДНК, пипетку лабораторную, пару коробок с дополнительными насадками для пипетки, стерильные ватные палочки для сбора ДНК обойдется в 149 фунтов. Каждому, кто приобретает Bento Lab авторы проекта гарантируют консультационную поддержку в Skype в течение полугода.

image

Очень хотелось бы, чтобы у энтузиастов-авторов уникального на сегодняшний день прибора Bento Lab все получилось так, или лучше, чем они ожидают. В соответствии с их планами первые комплекты с компактными лабораториями будут отправляться покупателям уже с ноября 2016 года.

Страничка проекта на Kikstarter



Уважаемые читатели, мы всегда с удовольствием встречаем и ждем вас на страницах нашего блога. Мы готовы и дальше делиться с вами актуальными новостями, обзорными материалами и другими публикациями, и постараемся сделать все возможное для того, чтобы проведенное с нами время было для вас полезным. И, конечно, не забывайте подписываться на наши рубрики.

Другие наши статьи и события

Комментарии (22)


  1. shteyner
    04.04.2016 11:34
    -1

    Вот жеж феномен Баадера-Майнхофа
    Походу дела эта тема очень сильно продвигается, причем сразу многими компаниями. Интересно. какая тут точность.
    https://nanoporetech.com/community/specifications — тут тоже по дешевке секвенсоры продают)


    1. PerlPower
      04.04.2016 12:45

      Там есть такой параметр как "Base calling accuracy up to 96%", это значит что до 4% нуклеотидов могут быть считаны неверно? И если так то что делается в таких случаях?


      1. shteyner
        04.04.2016 12:54

        Делается еще один тест) А вообще тут все же на процентном соотношении и строится. Вообще прикладная генетика не очень и точная наука (относительно). Да и 96% для большинства вещей более чем достаточно: проверить родство, посмотреть ген. заболевания, сравнить людей по образцу. Если нужно больше: несколько десятков миллионов долларов и у тебя будет лаборатория для картирования генома. Это штука большая, сложная + требует не одного человека персонала.

        • у них собственно это не конечное решение. В планах сделать оборудование не требующее дорогостоящих расходников. Но они это уже несколько лет говорят.


        1. PerlPower
          04.04.2016 18:17

          А где можно почитать про процесс картирования и его реалии на сегодняшний день? Просто с одной стороны я вижу новости что секвенирование уже почти пришло в каждый дом, а потом вижу что точность 99% это ого-го, только на миллионах пар погрешность выходит большая. И непонятно кто врет или просто по миру раскидано куча секвенсоров разных поколений, каждый из которых имеет свою точность.


          1. shteyner
            04.04.2016 18:41

            На именно такой вопрос структурированной информации не видел (тут ведь парой предложений не обойдешься). А вообще у нас на ГТ был отличный пост: https://geektimes.ru/post/137069/ всего 5 частей. Правда от 2012 года, так что несколько кстарели данные, но ничего критичного. Потом надо зайти на вики: https://ru.wikipedia.org/wiki/Методы_секвенирования_нового_поколения и почитать о каждом новом методе.
            Можно институтские лекции на ютубе посмотреть по данной теме.


  1. istui
    04.04.2016 13:38

    что реально может такая вещь?
    Из применений, которые приходят на ум сразу:

    • анализ вирусов/бактерий — чтобы понять, чем человек заболел и лечить пристрельно
    • проверить наличие тех или иных генов
    • проверить принадлежность чего-либо со следами днк конкретном человеку
    • определить сорт растения
    • установить родство


  1. arheops
    04.04.2016 21:08

    Поъоже на то, что только сравнить два образца(тоесть третье и пятое)


    1. gleb_kudr
      04.04.2016 21:59
      +1

      Нет, оно способно провести любой не-количественный ПЦР анализ. А это, например, анализ на ГМО, анализы на родство (в т.ч. сравнение образцов на идентичность), анализ на наличие определенной инфекции.
      Как бывший в прошлом профессиональный генетик скажу. Если эта штука реально выполняет заявленные функции, то это просто идеальный прибор для портативной лаборатории. Дешевый, компактный — все в одном.


      1. Festour
        05.04.2016 03:00

        Т.е. эта штука может только сказать одинаковые ли это гены или нет? И она не может оцифровать гены?


        1. gleb_kudr
          05.04.2016 11:20
          +1

          Секвенирование на ней сделать нельзя.


          1. vvzvlad
            05.04.2016 17:35

            А что она может-то?


  1. Uris
    05.04.2016 06:07

    Визуальный просмотр и интерпретация результата оказывается возможной благодаря гелевому электрофорезу и подсвеченной пластине прибора.

    С помощью бромистого итидия? Если так — то молодцы. Десяток, другой анализов без специальных средств защиты, вытяжки, санации — и уже делать анализы не надо. Токсическое отравление гарантировано… И еще. Выделение ДНК и форез в одном месте? Ещё больше молодцы. Кантоминация то как-же? Да уж))))


    1. gleb_kudr
      05.04.2016 11:24
      +1

      Этидий не настолько ядовитый, как вы пишите.

      Кантоминация

      Контаминация. Но заметили вы абсолютно верно — это существенный минус установки. Тоже пришла в голову эта мысль. Для всех — речь о том, что концентрированные препараты ДНК после ПЦР могут и будут загрязнять исходные образцы при пробоподготовке. Загрязнение передается просто с пылью, так как там для ложной реакции нужны единицы молекул.


      1. Uris
        05.04.2016 18:49

        Этидий еще и мутаген. Ничего полезного в нем нет. Конечно, за отравление быть может я переборщил. За 'а' в контаминации отдельное спасибо. Ну проруха и старуха все такое… Бывает.


  1. artoym
    05.04.2016 11:00

    На самом деле такие аппараты в целом существуют. Я видел подобное у ДНК-Технологии ещё 5 лет назад. Да, у них это большой кейс с несколькими отдельными приборами, а не 3-в-1. Вопрос в точности, сертификатах (если это не для домашнего использования), ну и далее в цене.


  1. Brandashmig
    05.04.2016 13:54

    Возможность реального применения будет лимитирована доступностью праймеров для амплификации нужных участков ДНК.


  1. istui
    05.04.2016 14:37
    +1

    а где вообще можно доступно почитать про генетику/молекулярную биологию? в общих чертах, сильно не углубляясь…


    1. artoym
      05.04.2016 15:03
      +2

      Могу предложить видеолекции физтеха.


  1. ktoon
    08.04.2016 16:36
    +1

    www.youtube.com/watch?v=lBi-d6jAKxQ&feature=youtu.be
    Доступно о ПЦР(полимеразная цепная реакция)


    1. istui
      09.04.2016 12:09

      а за счет чего пробы, содержащие амплифицированную ДНК, движутся к электроду?


      1. ktoon
        12.04.2016 10:31

        заряд


        1. istui
          12.04.2016 11:31

          я понимаю, что заряженные частицы в геле медленно диффундируют к нужному электроду, меня интересовало, от чего заряд имеет именно проба с нужным фрагментом НК? (наверное, сначала неправильно выразил мысль)