На данную тему была написана не одна сотня статей, но во всех, что видел, для построения двоичного дерева поиска использовались структуры по типу приоритетной очереди, хотя достаточно отсортировать массив частот в порядке убывания и отбрасывать последние две буквы с самыми маленькими частотами из алфавита, объединяя их в новую "псевдо-букву", но можно даже обойтись без постройки бинарного дерева поиска, чтобы сжать данные. В этой статье хотел представить реализацию данного алгоритма на языке C++.
Канонический алгоритм Хаффмана для сжатия можно разделить на следующие шаги:
Подсчёт частот каждой буквы в файле и составление алфавита.
Построение элементарного кода для каждой буквы алфавита.
Сжатие данных с помощью полученных элементарных кодов.
Процесс сжатия происходит за две процедуры чтения файла, сначала считываем файл для получения частот букв, потом считываем файл и заменяем букву алфавита на её элементарный код.
Ниже представлен код для подсчёта частот букв в файле. В качестве хранилища для частот использован вектор letter_count, по сути представляет из себя ассоциированный массив <буква, частота>, чтобы получить доступ к частоте буквы, достаточно обратиться по индексу, равному численному представлению буквы в кодировке.
void count_frequency(const std::string &filename, std::vector<uint64_t> &letter_count)
{
std::ifstream file(filename, std::ios_base::binary);
uint8_t c;
while ( file.read((char* )&c, 1) )
letter_count[c]++;
file.close();
}
struct data_about_letter_vector
{
std::vector<uint8_t> letter_vector;
uint64_t count;
};
void create_alphabet(std::vector<data_about_letter_vector> &alphabet, const std::vector<uint64_t> &letter_count)
{
size_t size = 0;
for (size_t i = 0; i < 256; i++)
if ( letter_count[i] ) {
alphabet[size].letter_vector.push_back(i);
alphabet[size].count = letter_count[i];
size++;
}
alphabet.resize(size);
}
void count_frequency_and_create_alphabet(const std::string &filename, std::vector<data_about_letter_vector> &alphabet)
{
std::vector<uint64_t> letter_count(256);
count_frequency(filename, letter_count);
create_alphabet(alphabet, letter_count);
}
Далее приступаем к формированию элементарных кодов для каждой буквы алфавита.
bool compare(const data_about_letter_vector &left, const data_about_letter_vector &right)
{
return left.count > right.count;
}
void create_elementary_codes(std::vector<uint64_t> &B, std::vector<uint8_t> &shift, const std::string &filename)
{
std::vector<data_about_letter_vector> alphabet(256);
count_frequency_and_create_alphabet(filename, alphabet);
size_t size = alphabet.size();
std::sort(alphabet.begin(), alphabet.end(), compare);
std::vector<uint8_t> temp_array(256);
while ( size > 2 ) {
size_t pos0 = size - 2, pos1 = pos0 + 1;
for ( uint8_t a : alphabet[pos0].letter_vector )
shift[a]++;
for ( uint8_t a : alphabet[pos1].letter_vector ) {
B[a] = ( 1ULL << shift[a] ) | B[a];
shift[a]++;
}
size_t temp_array_size = 0;
for ( uint8_t a : alphabet[pos0].letter_vector )
temp_array[ temp_array_size++ ] = a;
for ( uint8_t a : alphabet[pos1].letter_vector )
temp_array[ temp_array_size++ ] = a;
uint64_t sum_count = alphabet[pos0].count + alphabet[pos1].count;
size -= 2;
alphabet.resize(size);
uint8_t pos_to_insert = size;
while ( pos_to_insert && ( alphabet[ pos_to_insert - 1 ].count < sum_count ) )
pos_to_insert--;
alphabet.insert(alphabet.begin() + pos_to_insert, data_about_letter_vector());
alphabet[pos_to_insert].count = sum_count;
alphabet[pos_to_insert].letter_vector.resize(temp_array_size);
for (size_t i = 0; i < temp_array_size; i++)
alphabet[pos_to_insert].letter_vector[i] = temp_array[i];
size++;
}
if ( size == 1 )
shift[ alphabet[0].letter_vector[0] ]++;
else {
size_t pos0 = size - 2, pos1 = pos0 + 1;
for ( uint8_t a : alphabet[pos0].letter_vector )
shift[a]++;
for ( uint8_t a : alphabet[pos1].letter_vector ) {
B[a] = ( 1ULL << shift[a] ) | B[a];
shift[a]++;
}
}
}
Элементарные коды сформированы, можно приступать к сжатию данных. Однако для разжатия данных, необходимо будет сохранить элементарные коды, в данной реализации они представляют из себя два вектора, один содержит элементарный код для букв алфавита(вектор B), другой длину этого самого элементарного кода(вектор shift). Помимо всего реализация имеет один изъян, последний байт может быть не до конца сформирован, из-за чего в процессе разжатия данные могут быть неправильно проинтерпретированы. Поэтому, если байт не был до конца сформирован, то просто пишу его длину в битах и его значение в отдельный файл данных, необходимых для разжатия.
void write_elementary_codes_into_file(const std::vector<uint64_t> &B, const std::vector<uint8_t> &shift, const uint8_t &length_of_last_byte, const uint8_t &last_byte)
{
std::ofstream out("data_for_decompress.bin", std::ios_base::binary);
out.write((char* )&length_of_last_byte, 1);
out.write((char* )&last_byte, 1);
out.write((char* )&( B[0] ), 2048);
out.write((char* )&( shift[0] ), 256);
out.close();
}
void compress_file(const std::vector<uint64_t> &B, const std::vector<uint8_t> &shift, const std::string &filename)
{
std::cout << "Начало сжатия\n";
uint8_t byte = 0, length = 0, c;
std::ofstream out("compressed_data.bin", std::ios_base::binary);
std::ifstream file(filename, std::ios_base::binary);
while ( file.read((char* )(&c), 1) ) {
uint64_t elementary_code = B[c];
uint8_t s = shift[c];
uint64_t mask = ( 1ULL << s ) - 1;
while ( s ) {
uint8_t need_bit_length = 8 - length;
if ( need_bit_length > s ) {
byte |= elementary_code << ( need_bit_length - s );
length += s;
s = 0;
}
else {
s -= need_bit_length;
byte |= elementary_code >> s;
mask >>= need_bit_length;
elementary_code &= mask;
out.write((char* )&byte, 1);
byte = 0;
length = 0;
}
}
}
out.close();
file.close();
write_elementary_codes_into_file(B, shift, length, byte);
}
Со сжатием закончили, далее разжатие. Для разжатия необходимо построение двоичного дерева поиска по записанным ранее в файл элементарным кодам.
Код для дерева был украден, но была модифицирована функция добавления элемента в дерево.
Поиск по двоичному дереву для декодирования элементарного кода в букву представляет из себя переход от корня дерева по его потомкам(1 - означает перейти к правому потомку, 0 - к левому) до тех пока не найдем лист, который содержит букву. way - это и есть элементарный код, элемент вектора B, way_length - это длина элементарного кода, элемент вектора shift.
class Tree_element
{
public:
bool data_exist;
uint8_t data;
Tree_element* left;
Tree_element* right;
Tree_element();
};
class Binary_tree
{
public:
Tree_element* root;
Binary_tree();
~Binary_tree();
void delete_tree(Tree_element* current);
void insert(const uint8_t &letter, const uint64_t &way, const uint8_t &way_length);
};
Tree_element::Tree_element()
{
data_exist = false;
left = NULL;
right = NULL;
}
Binary_tree::Binary_tree()
{
root = new Tree_element();
}
void Binary_tree::delete_tree(Tree_element* current)
{
if ( current ) {
delete_tree(current->left);
delete_tree(current->right);
delete current;
}
}
Binary_tree::~Binary_tree()
{
delete_tree(root);
}
void Binary_tree::insert(const uint8_t &letter, const uint64_t &way, const uint8_t &way_length)
{
uint64_t mask = 1ULL << ( way_length - 1 );
Tree_element* current = root;
while ( mask ){
if ( way & mask ) {
if ( !current->right )
current->right = new Tree_element();
current = current->right;
}
else {
if ( !current->left )
current->left = new Tree_element();
current = current->left;
}
mask >>= 1;
}
current->data = letter;
current->data_exist = true;
}
Чтение данных, необходимых для разжатия.
void read_data_for_decompress(std::vector<uint64_t> &B, std::vector<uint8_t> &shift, uint8_t &length_of_last_byte, uint8_t &last_byte)
{
std::ifstream file("data_for_decompress.bin", std::ios_base::binary);
file.read((char* )&length_of_last_byte, 1);
file.read((char* )&last_byte, 1);
file.read((char* )&( B[0] ), 2048);
file.read((char* )&( shift[0] ), 256);
file.close();
}
Построение двоичного дерева поиска по элементарным кодам.
void create_binary_tree_of_elementary_codes(uint8_t &length_of_last_byte, uint8_t &last_byte, Binary_tree &tree)
{
std::vector<uint64_t> B(256);
std::vector<uint8_t> shift(256);
read_data_for_decompress(B, shift, length_of_last_byte, last_byte);
std::vector<uint8_t> alphabet(256);
size_t size = 0;
for (size_t i = 0; i < 256; i++)
if ( shift[i] )
alphabet[size++] = i;
size_t count = 0;
for (size_t i = 0; i < size; i++)
tree.insert(alphabet[i], B[ alphabet[i] ], shift[ alphabet[i] ]);
for (size_t i = 0; i < size; i++)
count += (size_t)( get_letter_by_way(B[ alphabet[i] ], shift[ alphabet[i] ], tree.root) == alphabet[i] );
if ( count != size ) {
std::cout << "Ошибка в создании двоичного дерева поиска.\n";
exit(2);
}
}
Разжатие данных.
void decompress_data_from_file(Tree_element* const root, const std::string &filename, uint8_t &length_of_last_byte, const uint8_t &last_byte)
{
std::cout << "Начало разжатия\n";
std::ifstream reading("compressed_data.bin", std::ios_base::binary);
std::ofstream writing(filename, std::ios_base::binary);
Tree_element* current = root;
uint8_t byte = 0;
while ( reading.read((char* )&byte, 1) ) {
uint8_t mask = 1 << 7;
while ( mask ) {
do {
if ( byte & mask )
current = current->right;
else
current = current->left;
mask >>= 1;
} while ( mask && !current->data_exist );
if ( current->data_exist ) {
writing.write( (char* )&( current->data ), 1);
current = root;
}
}
}
uint8_t mask = 1 << 7;
while ( length_of_last_byte ) {
do {
if ( last_byte & mask )
current = current->right;
else
current = current->left;
mask >>= 1;
length_of_last_byte--;
} while ( !current->data_exist );
writing.write( (char* )&( current->data ), 1);
current = root;
}
reading.close();
writing.close();
}
Плюсы реализации:
Канонический алгоритм Хаффмана для построения элементарных кодов.
Использование побитовых операций.
Нет необходимости хранить алфавит, алфавит можно восстановить по вектору shift, если длина элементарного кода для буквы равна нулю, то буквы нет в алфавите.
Минусы реализации:
Костыли для обработки несформировавшегося байта.
Куча библиотек, а именно <vector>, <string> и <algorithm>(отсюда взята сортировка).
Отсутствие возможности выбора размера буквы.
Большой размер файла необходимого для разжатия данных. 2 + 256 * 8 + 256 байт.
Интересной особенностью реализации является то, что она не требует построения двоичного дерева поиска для сжатия данных.
Алгоритм Хаффмана прекрасно сжимает текстовые файлы, когда размер алфавита не очень большой и символы встречаются часто. С другими типами файлов ситуация хуже, поэтому использовать его для них неоптимально.
Полный код, разделённый на модули, можно посмотреть по ссылке
Написание статьи вдохновлено прочтением книги: Ватолин Д., Ратушняк А., Смирнов М., Юкин В. "Методы сжатия данных. Устройство архиваторов, сжатие изображений и видео." - М.: ДИАЛОГ-МИФИ, 2003. - 384 с
Комментарии (17)
voldemar_d
29.05.2024 12:40Куча библиотек, а именно <vector>, <string> и <algorithm>
Почему это отнесено к недостаткам?
И раз сжимаются текстовые данные, почему бы не подсчитывать частоту слов, а не букв?
hokusi Автор
29.05.2024 12:40Использование сторонних библиотек всегда отпугивало, но решил включить, так как сам могу реализовать данные СД и алгоритм сортировки, пусть и в стократ хуже, чем в это представлено в данных библиотеках. Личная оценка автора статьи, грубо говоря.
Не совсем понял, что Вы имеете в виду. Если говорить в терминах теории информации, где слово - это R-бит, но чаще всего R-байт, то канонический алгоритм Хаффмана работает с однобайтовыми словами. Но мы можем в теории обрабатывать и 8-байтовые слова, то есть uint64_t, да и алгоритм Хаффмана относится к алгоритм сжатия на основе алфавита, сжатие данных на основе словаря это уже скорее про LZ.
voldemar_d
29.05.2024 12:40пусть и в стократ хуже, чем в это представлено в данных библиотеках
Я примерно это и имел ввиду - обычно изобретение велосипеда результат дает вряд ли лучше.
сжатие данных на основе словаря это уже скорее про LZ
Действительно, я и забыл.
Zara6502
немного включу зануду, но это при условии что вы не грузите файл в ОЗУ.
hokusi Автор
Здравствуйте, не совсем пынял, что Вы имеете в виду. В любом случае мы не можем напрямую работать с данными на дисках, всегда будет использоваться ОЗУ в качестве буфера. Данное замечание было сделано, так как изначально, до 2 редакции, реализация считывала данные из файла и писала по-байтово в динамический массив. Или Вы имеете в виду то, что так как поток на чтение был открыт, то часть данных останется в ОЗУ? Если честно не разбирался, но если Вам известны источники раскрывающие данную тему, то прошу Вас поделиться, был бы рад почитать.
Zara6502
ну если примитивно берём чистый ДОС без smartdrv и обращаемся к файлу через библиотеку стандартного ввода-вывода, то читая 1 байт, вы обращаетесь к диску, с которого считывается сектор (Х байт), но лично вашей программе отдаётся тот самый байт. Этот сценарий мы не рассматриваем.
В современных ОС прослойкой будет кеш системы, то есть даже читая с диска вы все равно во второй раз будете иметь дело с ОЗУ.
Но я и не такой сценарий имею в виду. Я о том, что по хорошему в программе имеет смысл делать две процедуры чтения, одна обращается к части файла по размеру выделенного буфера, а вторая тупо грузит весь файл в ОЗУ. Вот и получается, что дял современной системы большинство файлов просто уместятся в ОЗУ и ваша фраза "за два чтения файла" несколько некорректна, скорее "за две операция чтения данных". То есть описывая алгоритм не нужно создавать некие условия работы исключительно с диском, это просто данные, а на диске они или в ОЗУ - не важно.
Вот вам пример из моей программы, которая производит расчёт энтропии.
Как видно по коду, я взял за основу 16 Мб и всё что меньше идёт через CalcMapFast с полным чтением в ОЗУ, а всё что больше читается порциями по 16 Мб в CalcMap.
hokusi Автор
Пынял, спасибо Вам большое за ответ, не задумывался о том, что в какой-то момент эффективней будет считать какое-то большое количество байт, чем считывать по одному.
zzzzzzerg
Вы же в курсе что вы таким образом теряете оригинальный callstack ошибки?
Ваш вариант CalcMapFast принципиально ничем не отличается от CalcMap, можете посмотреть на реализацию ReadAllBytes
hokusi Автор
Крайне поверхностно знаком с языком Ассемблера, но данная ошибка вылезет же только в том случае, если процедура будет вызываться рекурсивно, разве нет?
zzzzzzerg
Хм, если это вопрос ко мне - то тут нет языка Ассемблера и нет рекурсии. Поэтому не понимаю, о чем вы спрашиваете.
hokusi Автор
Не совсем пынямаю как может произойти call stack ошибка.
zzzzzzerg
Не "call stack ошибка", а call stack или stack trace ошибки. Т.е. список вызовов до вызова, который выбросит исключение. В данном случае вызов любой системной функции внутри блока try/catch может выбросить исключение, которое будет отловлено в блоке catch и выброшено снова, но без информации об оригинальном списке вызовов.
Zara6502
Мне можно, я профессиональный говнокодер.
Ну для меня различия очевидны и они есть в коде. Но готов услышать от вас комментарии, я не против саморазвития.
zzzzzzerg
В ReadAllBytes практически такой же цикл как у вас.
Zara6502
там
то есть память выделяется сразу вся в ОЗУ, что соответствует CalcMapFast, причем ограничение там только такое, мои 16 Мб по сравнению с ними просто ни о чём
а цикл
он же не про чтение частями, просто filestream.Read возвращает число прочитанных байт, то есть формально для того чтобы всё же прочитать столько сколько нужно придется сдвигать offset (num) и менять count (num2). Тут смысл совсем иной.
zzzzzzerg
Ваш текст "я взял за основу 16 Мб и всё что меньше идёт через CalcMapFast" - так что вы маленькие файлы читаете полностью в ОЗУ и они полностью влезают в ваши 16Мб, если читать их через CalcMapFast, так что ограничение на Int.MaxValue оно не про ваш случай. И в вашем цикле в CalcMap чуть меньше телодвижений (как раз про сдвиги смещений). И вы таже будете вычитывать данные в массив пока не прочтете весь файл (даже если он маленький и ОС будет вам отдавать его частями).
Эквивалентность кода довольно очевидна, но убеждать вас я не хочу.
Zara6502
я понял что вы имеете в виду, мои показанные два метода взяты из старого исходника, свежее найти быстро не смог, там код отличается, для метода CalcMap происходит чтение блоками по размеру буфера.
В общем вы всё правильно написали, а я сам себя запутал.