Команда Гарвардской Медицинской Школы, состоящая из специалистов-генетиков, расшифровала полный геном мамонта. Причем расшифрованы геномы не одной, а сразу двух особей. Результаты этой работы опубликованы в авторитетном журнале Current Biology. При этом в работе показан примерный путь развития и становления вида.
Мохнатые мамонты появились примерно 700000 лет назад, в Сибири. Затем популяция мамонтов распространилась по всей Восточной Европе и Северной Америке. При этом, судя по ДНК, мамонты едва не вымерли 280 тысяч лет назад и около 12 тысяч лет назад. В самом конце существования популяция мамонтов сократилась до 1 тысячи особей. Последние мамонты жили в Сибири примерно 6 тысяч лет назад, пока внутривидовое скрещивание не привело к полному вымиранию мамонтов.
Вот уже несколько лет ученые пытаются извлечь и расшифровать ДНК мохнатых слонов, для возможного возрождения вида. В 2008 году Пенсильванский Государственный Университет попытался извлечь образец ДНК из тканей замороженного мамонта. Попытка оказалась неудачной. Затем последовала попытка ученых из Южной Кореи. Ученым удалось немного больше, и сейчас корейцы пробуют расшифровать образцы ДНК из тканей особи, погибшей где-то 40000 лет назад. Предыдущие проекты принесли значительные результаты — ученым удалось извлечь достаточно длинные образцы генома, хотя это и не были полные образцы ДНК. Только сейчас ученым из Гарварда удалось извлечь неповрежденную ДНК, и расшифровать геном древних животных.
Как ранее сообщалось, эта же команда ученых успешно осуществила пересадку генов мамонта азиатскому слону, используя метод CRISP. Специалисты взяли гены из ДНК мамонтов с острова Врангеля, задействовав участки генома, отвечающие за шерсть, размер ушных раковин, подкожный жир и гемоглобин. Англичане утверждают, что в настоящее время у них есть живые клетки слонов со встроенным ДНК мамонта.
Комментарии (15)
zvic
24.04.2015 19:00+3Пенсильванский Государственный Университет
Это не опечатка, это просто незнание реалий. Практически каждая статья с упоминанием учебного учереждения в США содержит в себе ошибки перевода названия данного учереждения. И в вышеупомянутой статье с видео от Бет Шапиро неправильно переведено название University of California in Santa Cruz. И в данной статье Pennsylvania State University переводится не как Пенсильванский Государственный Университет, а Университет штата Пенсильвания.
А ведь для правильного перевода названия часто достаточно просто заглянуть в Википедию, найти там англоязычное название и посмотреть соответствующее название на русском.
Nomad1
25.04.2015 16:55Мне нравится научная часть этого проекта — амбициозно, реально интересно и будет действительно здорово увидеть мохнатых вживую. Но что с биологическим аспектом — им в природе есть где жить, что есть? Или по большому счету все хоботные на этой планете обречены и отдельные экземпляры останутся лишь только в зоопарках?
eugenius_nsk
27.04.2015 14:40Но что с биологическим аспектом — им в природе есть где жить, что есть?
ru.wikipedia.org/wiki/Плейстоценовый_парк, www.pleistocenepark.ru/ru
Halt
25.04.2015 19:44Интересно, зачем было буквально рыться в костях в поисках фрагментов ДНК, если в вечной мерзлоте находили практически неповрежденные туши мамонтов? Если даже мягкие ткани сохранились, то уж ДНК и подавно должно быть в сохранности.
a5b
26.04.2015 06:20+1То что туша выглядит «совсем как живая» (или не совсем) еще не значит, что хрупкие биологические молекулы полностью сохранились. Ancient DNA (enwiki):
..due to degradation of the DNA molecules, a process which correlates loosely with factors such as time, temperature, and presence of free water, upper limits exist beyond which no DNA is deemed likely to survive.… The DNA degrades in an exponential decay process. According to their model, mitochondrial DNA is degraded to 1 base pair after 6,830,000 years at ?5 °C.… Nuclear DNA degrades at least twice as fast as mtDNA.
Секвенирование древней ДНК
ДНК со временем повреждается в результате случайного гидролиза или окисления. К гидролитическим повреждениям относятся разрушение фосфатного остова цепи, депуринизация и дезаминирование… Кроме того, возникают поперечные сшивки между цепями спирали ДНК из-за алкилирования или сшивки ДНК с различными молекулами в результате реакции Майяра.… Средняя длина амплифицируемых фрагментов древней ДНК часто не превосходит 100 п.н., причем для находок из одного места раскопок средняя длина фрагментов убывает с увеличением возраста находки…
Под контаминацией понимается попадание в образец чужеродной ДНК во время захоронения, при извлечении, хранении или исследовании. Часто вследствие контаминации лишь малая доля ДНК в образце имеет эндогенное происхождение. Лучшие в этом отношении образцы содержат до 90 % эндогенной ДНК.
Не читал полной статьи http://www.cell.com/current-biology/abstract/S0960-9822(15)00420-0, по которой писали эту новость, однако ранее образцы из вечной мерзлоты уже использовались для получения ДНК, например в 2008 г: «Whereas many ancient-DNA studies have used bone samples, in 2007 we showed that DNA with fewer damage-induced substitutions can be extracted from hair shafts collected from permafrost remains»
PS: «сейчас ученым из Гарварда удалось извлечь неповрежденную ДНК» в тексте данного поста звучит как художественное преувеличение…Halt
26.04.2015 07:37Спасибо за столь развернутый ответ!
Безусловно вы правы, я и не рассчитывал что ДНК можно будет прочитать в первозданном виде. В то же время, кажется естественным, что чем менее поврежден организм, тем целее будет его генетический материал. Почему и задался вопросом, зачем потрошить кости, если можно набрать много образцов из тканей.
lasc
28.04.2015 02:26+1Даже как то с Моа прогресса особо нет, а они совсем недавно вымерли.
www.3news.co.nz/politics/mallard-bring-the-moa-back-to-life-within-50-years-2014070117#axzz3YYToqkhp
a5b
Перевод видео: geektimes.ru/company/vertdider/blog/249456 вчера в 21:34
Бет Шапиро — Древние ДНК: что это такое и чем могло бы быть?
Научно-популярное*, YouTube*, Блог компании Vert Dider. Genestr
Научная публикация о данной расшифровке:
Eleftheria Palkopoulou, Swapan Mallick, Pontus Skoglund, Jacob Enk, Nadin Rohland, Heng Li, Ayca Omrak, Sergey Vartanyan, Hendrik Poinar, Anders Gotherstrom, David Reich, Love Dalen
Complete Genomes Reveal Signatures of Demographic and Genetic Declines in the Woolly Mammoth // Current Biology, DOI: dx.doi.org/10.1016/j.cub.2015.04.007
Kalobok
Что-то смущают меня некоторые моменты. Например, утверждение, что до сих пор не расшифрован геном ни одного позвоночного. Не вяжется с этим и этим.
dmzkrsk
Возможно, речь идёт о полной, а не частичной расшифровке
Kalobok
Что подразумевается под полной расшифровкой? По ссылке на википедию:
Собственно, пересмотрел этот кусок еще раз — речь идет о нерасшифрованном 1% гетерохроматина, который, судя по всему, не несет никакой смысловой нагрузки.
a5b
Есть некоторая разница между «прочитан код ДНК» (Секвенирование — считаны все буквы и результат сведен в более-менее последовательный вариант — при этом обычно неточно считываются некоторые типы повторов; не считывается метилирование) и расшифровкой генома.
en.wikipedia.org/wiki/Genome_project
Бет говорит на 5:30 о «completely sequenced», уточняет, что генетическая последовательность человека прочитана на 99%, на 5:50 упоминает о heterochromatin, повторы в котором сложны для секвенирования
Kalobok
Да, я уже нашел этот момент.
yallie
Странно, что в этом видеоролике Бет Шапиро говорит о том, что геном мамонта расшифрован только на 50%.
yallie
Пардон, это речь шла о прошлой работе 2008 года.