Различие модуля и расширения:

Расширение (plugin/addon) - работает в официальном редакторе Godot и не требует никаких дополнительных действий, и работает со стандартными шаблонами экспорта.

Модуль (module) - требует модификации исходного кода и сборки всего редактора Godot, также сборки каждого из шаблонов для экспорта на каждую из платформ.

Кроссплатформа - расширения используют только возможности движка Godot поэтому они все совместимы со всеми поддерживаемыми платформами, модули в зависимости от кода модуля там может быть непереносимый код, я не встречал таких.

Установка модулей и расширений:

Расширения (plugin/addon) - для установки скопируйте расширение в каталог addons в вашем проекте. Структура должны быть такой - addons/<название расширения>/, достаточно скопировать <название расширения> в каталог addons. И включить в опциях проекта Проект (Project) - Настройки проекта (Project Settings)

Модули (module) - в большинстве случаев достаточно скопировать каталог с модулем в godot_<версия исходный код>/modules/<название модуля> и сделать сборку Godot редактора и нужных шаблонов следуя инструкции. После сборки функционал модуля станет доступным.

Расширения:

Godot Console - позволяет создавать простой UI элемент Консоль, и просто добавлять туда команды, полезно во многих случаях.

Godot-3D-text-plugin - позволяет прямо в редакторе создавать трехмерный объект(mesh) в форме текста, создавать буквально двумя кликами, есть поддержка шрифтов. Для получения объекта нажать Convert to MeshInstance.

smoothing-addon - позволяет просто создавать плавную интерполяцию положения трехмерных объектов, больше информации по ссылке на расширение. Видео использования, физический ФПС установлен на 8, слева реальная позиция, справа используя smoothing-addon:

3D Trail addon for Godot - оставляет плоский след за объектами, к сожалению геометрия следа генерируется на CPU, что даст сильную нагрузку при использовании на десятках объектах одновременно. Лучше всего использовать не более чем на нескольких объектах.

Concept Graph - я не тестировал и не пользовался, для ознакомления рекомендую посмотреть видео в этом твите автора, позволяет создавать сложные правила для трехмерных объектов, что дает комплексный результат. Похоже на визуальное программирование, код писать не надо.

Scatter - для его работы требуется другой плагин Polygon Path, позволяет делать дубликаты одного объекта в выделенной области, например трава или деревья.

Godot-Planar-Reflection-Plugin - создание отражений с помощью камеры. Может пригодиться для реалистичных отражений. Можно также использовать для отражений в воде Больше информации и примеров по ссылке.

gdscript-pp - я не пробовал это расширение, позволяет конвертировать GDScript в C++ код который может быть скомпилирован с движком, что избавляет от проблем и узких мест GDScript. Есть ограничения например требуется строгая типизация в GDScript, если сделаете var x=10 и потом x="Hello" такое не поддерживается, var x:int=10 так будет работать. Выглядит очень полезно для ускорения готовой игры/проекта, конвертируя скрипты в C++ код.

Дальше не совсем плагины, просто готовые полезные шейдеры, скрипты, и примеры:

Godot Realistic Water - хороший и быстрый шейдер воды с выделением (используя depth) объектов пересекающих воду.

Godot_force_shield_shader - простой эффект энергетического щита, главное то что реализована логика выделения пересекающих объектов используя depth.

Screen-Space-Decals - логика отпечатков на шейдерах, так как в Godot 3 нет поддержки decals. Более комплексное использование этой техники в Godot я описал в своей статье на хабре ссылка, где есть ссылки на исходный код моего измененного шейдера.

Simple Wind Shader - пример использования и создания шейдера анимации движения травы и листвы под действием ветра.

Mirror example - проект с примером создания зеркала.

Camera Control Script - очень полезный скрипт для контроля камеры, по сути шаблон для всех трехмерных камер.

Модули:

Futari-addon - очень полезный модуль для GPU-частиц, позволяет добавлять физический коллайдер сферу или плоскость, и частицы будут взаимодействовать с ними, также можно добавлять области с ускорением на подобии ветра. Эта логика работает и в WebGL2. На хабре есть статья с моим примером использования этого модуля. Есть демо проект от автора.

HeightMap terrain plugin - создание площадей как карты высот, есть поддержка разных текстур, травы, также LOD и физика. Полноценный HeightMap с которым можно делать все что требуется.

Voxel Tools for Godot - создание воксельных миров и их редактор в реальном времени, банально по типу Майнкрафта, есть опция сглаживания геометрии, будет похоже на HeightMap без кубиков. Больше скриншотов и информации по ссылке.

Godot-lportal - добавляет поддержку occlusion culling в Godot 3. Я лично не нашел применения этому плагину, по утверждению автора этот плагин позволяет делать даже порталы в Godot 3 без потери производительности. Также, возможно, этот плагин будет добавлен в Godot 3 в будущем.

Godot-lsimd - добавляет поддержку SIMD в Godot 3. Использовать можно прямо в GDScript, ускоряя работу с массивами и большими объемами данных.